保健食品经营企业卫生许可证是需要经过食品药品监督管理局审批的。保健食品经营企业卫生许可证办理的相关依据是：依据《中华人民共和国食品安全法》(中华人民共和国主席令第九号(第二十九条、第五十一条)、《 中华人民共和国行政许可法》(中华人民共和国主席令第七号)、《保健食品管理办法》(卫生部令第46号)、《食品卫生许可证管理办法》(卫监督发[2005]498号)

办理保健食品经营企业卫生许可证的相关材料有：

1、《市保健食品(经营)卫生许可证申请书》;

2、营业执照复印件1份;新开办企业提供(法定代表人或者负责人资格证明复印件(董事会决议或任命文件)、身份证复印件以及工商行政部门出具的预先核准证明复印件);

3、经营场所的使用证明(房屋/土地产权证明或者租赁协议复印件);

4、经营场所场地平面布局图;

5、企业卫生管理组织和制度的材料、质量保证体系及质量控制的相关文件;(产品索证制度或首营制度，以及人员、场地的卫生管理制度);

6、从业人员健康检查证明复印件1份;

7、从业人员保健食品卫生知识培训材料1份;

8、食品药品监督管理部门认为有必要提供的其他材料;

9、申报材料真实性的自我保证声明，包括企业对材料作出如有虚假承担法律责任的承诺;

10、凡申请企业申报材料时，申请人不是法定代表人或负责人本人，企业应当提交《授权委托书》。

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1法人企业及其分支机构必须由法定代表人在申请表格、申请材料上签名并加盖企业公章。

2经办人不是申请企业法定代表人或企业负责人本人的须提交《授权委托书》原件及经办人身份证复印件。

3个体户由企业负责人本人持身份证原件办理注销手续。

以深圳市为例，是需要准备以下材料的，具体包括了：

1深圳市《保健食品经营企业卫生许可证》补发申请表

2《授权委托书》原件及经办人身份证复印件

3申请单位法定代表人和企业负责人身份证复印件

4申请企业营业执照正（副）本复印件

申请企业自刊登遗失声明之日起满25日后方可申请补发。经办人不是申请企业法定代表人或企业负责人本人的须提交《授权委托书》原件及经办人身份证复印件。

办理保健食品经营企业卫生许可证变更，是需要注意以下的几点：

①变更后的保健食品《保健食品批准证书》或《保健食品变更批件》等保健食品审批证明文件复印件。

②变更后的保健食品的包装标签、说明书复印件、变更后的国产保健食品12个月以内的卫生检验报告复印件。

③变更后的保健食品生产企业和供货商的《卫生许可证》和《营业执照》复印件。

④购销保健食品的意向书、授权书、或购销合同等证明文件复印件。

下面将简单说一说变更企业名称、变更法定代表人以及变更企业负责人的问题：

在变更企业名称的办理过程中，需提交市场监督管理局出具的已核准变更的证明文件复印件。在变更法定代表人的办理过程中，应提交上级主管部门或股东会议决议、人事任免决定、个人身份证复印件；或者是变更后的《营业执照》复印件。而变更企业负责人，则是在提交变更后的企业负责人身份证复印件和法定代表人或上级主管部门对负责人的任命书或者变更后的《营业执照》复印件；属于个体户的，不予变更企业负责人。

办理过程中，是需要准备以下办理材料的，包括了：

1、《保健食品经营企业卫生许可证》申请表。

2、保健食品经营企业保健食品拟销售清单。

3、工商行政管理部门的企业名称预先核准通知书（在原企业增加保健食品经营范围的，只须提交工商部门发放的《营业执照》（副本）复印件）。

4、法定代表人或拟任法定代表人资格证明：①履历表；②身份证；③任命通知书或股东协议书。

5、企业负责人资格证明：①履历表；②身份证；③任命书（具有上级主管部门的企业）。

6、质量负责人：①履历表；②身份证；③学历证明；④劳动合同和聘书。

7、营业场所有效使用证明材料。

8、经营场所和仓库（贮货区或柜）总平面图，包括摆放、存放区划图。

9、保健食品质量保证体系的情况（包括卫生管理机构、人员培训及体检记录、质量管理规章制度等）。

10、许可机关需要提供的其他资料。

普通食品的流通，应该到工商局办理《食品流通许可证》，保健食品的监管应该归属食品药品监督管理局。

通常来说，保健食品经营企业卫生许可证的办理是需要经过以下办理流程的，包括了：

1、递交申报材料齐全。符合受理条件，发给《受理通知书》；申报材料不齐全，不符合受理条件的，一次性告知补正全部材料；

2、自受理之日起，10个工作日内组织现场验收，验收合格的，发给《保健食品经营企业卫生许可证》；验收不合格的，将不合格原因告知申请人并退回申请资料。

在保健食品经营企业卫生许可证的办理过程中，是需要准备以下办理材料的，包括了：

1、《市保健食品（经营）卫生许可证申请书》；

2、营业执照复印件1份；新开办企业提供（法定代表人或者负责人资格证明复印件（董事会决议或任命文件）、身份证复印件以及工商行政部门出具的预先核准证明复印件）；

3、经营场所的使用证明（房屋/土地产权证明或者租赁协议复印件）；

4、经营场所场地平面布局图；

5、企业卫生管理组织和制度的材料、质量保证体系及质量控制的相关文件；（产品索证制度或首营制度，以及人员、场地的卫生管理制度）；

6、从业人员健康检查证明复印件1份；

7、从业人员保健食品卫生知识培训材料1份；

8、食品药品监督管理部门认为有必要提供的其他材料；

9、申报材料真实性的自我保证声明，包括企业对材料作出如有虚假承担法律责任的承诺；

10、凡申请企业申报材料时，申请人不是法定代表人或负责人本人，企业应当提交《授权委托书》。

在保健食品经营企业卫生许可证的办理过程中，是需要准备以下办理材料，包括了：

1、有单位的名称、住所、组织机构和章程;

2、有固定的办公地址，注册地址需与办公地址址一致，面积需30平以上;

3、至少有2名从业人员的健康证，且是由三甲以上的医院开具的。